提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

福建漳州：深入实施乡村振兴十大行动******

　　作为农业大市，近年来，福建漳州市深入实施乡村振兴十大行动重点任务，扎实推进乡村振兴试点示范项目建设，推动乡村产业、人才、文化、生态、组织全面振兴，巩固拓展脱贫攻坚成果，加快推进农业农村现代化。

　　“种业是农业的核心竞争力，是国家战略性、基础性核心产业。”在漳州市农业农村局一级调研员林德泓看来，乡村振兴需要持续加大对种业的支持力度，坚持品种与产业发展相结合，发挥良种支撑作用，加快推进农业农村现代化。

　　“漳州是农业大市，传统种植品种的经济价值渐渐低了，农户的收入也少了。农户要增收，发展优质品种尤其重要，好品种的效益能达到几倍甚至几十倍。”漳州市委副书记黄水木说，2022年，漳州市委、市政府启动了全市农业优新品种示范推广行动。2022年初，漳州市举办了农业优新品种推广行动研讨会和推介会，邀请中国科学院院士谢华安等13位种业领域的专家学者，经过充分研讨论证，遴选确定了100个漳州市适养适种优新品种。

　　针对每个优新品种，漳州各地分别指定1名专家“一对一”做好帮扶指导和提供技术咨询服务，定期组织专业技术人员、科技特派员深入各种养大户指导，做到良种良法两结合两促进。

　　2022年上半年，漳州市推广优新品种93个，立项示范片335个，完成全年立项计划任务197.06%，示范带动推广蔬菜、食用菌、水果、茶叶等种植面积12.4万亩，产值达到159.1亿元，新增产值11.7亿元。

　　眼下，漳州农业产业优势不断扩展，产业链条不断延伸，更多优质的特色农产品源源不断地从漳州大地产出。然而，对市场来说，只有形成品牌，才能基业长青。为此，漳州以“互联网+”“品牌+”的思维整合运营农产品，引导农业经营主体借助第三方电子商务平台或自建平台开设网店，拓宽农产品网络零售渠道，让农产品搭上“互联网快车”，让产品销往全国各地。

　　“产业区域特色的形成，以及品牌农业建设的不断加强，不仅提升了漳州农产品的美誉度，更给漳州农业带来了实实在在的经济效益。”黄水木说，截至目前，漳州市拥有中国名牌产品和名牌农产品各1个、福建名牌农产品（含加工品）156个、地理标志商标（产品）142件；共有23件涉农商标获得驰名商标保护，还有声名远播的平和琯溪蜜柚、白芽奇兰等8件地理标志商标。

　　乡村振兴关键在人。漳州依据《关于加强漳州市乡村人才振兴的八条措施》，加强乡村人才激励培养，推动教育人才资源向基层一线倾斜，支持人才向基层一线流动，鼓励引导各类人才投身漳州市乡村建设，加快培养造就一支懂农业、爱农村的乡村振兴人才队伍。

　　此外，漳州进一步选优配强市领导挂钩联系、驻村第一书记、市直单位党组织、乡村振兴工作队、科技特派员、市管干部乡村振兴指导员、乡村振兴金融指导员等“七支队伍”，壮大乡村振兴工作力量，让乡村更富更美。（本报记者 薛志伟 中国县域经济报记者 黄长秋）